数据集概述
本数据集为急性髓系白血病(AML)中MLL-EDC4融合祖细胞样细胞类型的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,包含六个AML样本的scRNA-seq读数计数矩阵及样本信息表格,用于研究MLL融合AML的肿瘤内异质性、发育阶段及相关基因表达特征,支持MLL融合白血病细胞类型的转录组分析。
文件详解
- 单细胞RNA-seq读数计数矩阵文件(共6个)
- 文件名称:p1000_scRNA-seq_counts.csv.gz、p0727_scRNA-seq_counts.csv.gz、p1002_scRNA-seq_counts.csv.gz、p1001_scRNA-seq_counts.csv.gz、p4760_scRNA-seq_counts.csv.gz、p1072_scRNA-seq_counts.csv.gz
- 文件格式:CSV.GZ
- 字段映射介绍:AML样本的scRNA-seq读数计数矩阵,记录细胞与基因的表达量数据
- 样本信息表格文件
- 文件名称:scRNA-seq_samples.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:描述AML样本的scRNA-seq样本信息,对应六个读数计数矩阵的样本详情
数据来源
论文“Progenitor like cell type of an MLL-EDC4 fusion in acute myeloid leukemia”(Blood Advances, Schuster et al., 2023)
适用场景
- 急性髓系白血病肿瘤内异质性研究: 分析MLL融合AML样本中不同细胞亚群的转录组特征及异质性
- MLL融合白血病细胞发育阶段分析: 探究MLL-EDC4融合细胞的祖细胞样特征及发育状态
- 白血病相关基因表达研究: 研究RUNX1、SOX4、CDK6等关键基因在MLL融合AML细胞中的表达模式
- 肿瘤微环境相互作用分析: 结合转录组数据探索MLL融合AML细胞与微环境的相互作用机制
- 白血病靶向治疗靶点筛选: 基于MLL-EDC4融合细胞的独特转录组特征,筛选潜在治疗靶点