数据集概述
本数据集包含灰礁鲨(Carcharhinus amblyrhynchos)的基因组研究数据,通过5517个核 SNPs 和线粒体 DNA 基因分析其遗传结构与选择信号。样本来自澳大利亚、印度尼西亚及印度洋远洋 reef,揭示地理隔离对基因流的影响、性别偏向扩散及局部适应的选择位点,为可持续管理提供基因组学依据。
文件详解
- DArT_Loci_Information_(Momigliano_et_al_2017).xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含DArT技术获得的基因座信息,可能涵盖位点编号、类型、注释等基础数据。
- Genotypes_of_All_Loci_Excluding_8_outliers_(Momigliano_et_al_2017).csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含除8个异常位点外的所有5509个位点的基因型数据,涉及样本编号、种群信息及各基因座的基因型数值。
- Genotypes_of_8_outlier_loci_(Momigliano_et_al_2017).csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含4个独立测试识别的8个候选选择位点的基因型数据,字段包括样本编号、种群(如Chagos、Cocos等)及各异常位点的基因型(如L116、L350等)。
- Genotypes_Loci_from_Fst_Core_Distribution_(Momigliano_et_al_2017).csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含基于Fst核心分布筛选的基因座基因型数据,反映中性遗传分化的核心位点信息。
数据来源
Momigliano et al. 2017研究(标题:Genetic structure and signatures of selection in grey reef sharks (Carcharhinus amblyrhynchos))
适用场景
- 海洋生物遗传结构分析:研究灰礁鲨种群的地理隔离、基因流模式及性别偏向扩散机制。
- 保护遗传学研究:识别局部适应的选择位点,为灰礁鲨的区域性保护策略制定提供依据。
- 基因组学方法验证:比较中性位点与选择位点的遗传分化模式,验证异质基因组分化的研究框架。
- 渔业可持续管理:基于遗传结构数据优化保护区划分与资源管理单元设定。