数据集概述
本数据集为所罗门群岛栗腹王鹟(Monarcha castaneiventris)三个近期分化岛屿种群的基因组分化研究数据,含约7万个SNP位点的基因组分化模式分析结果,验证了羽色分化相关候选基因(MC1R、ASIP)的作用,揭示了黑化种群趋同进化的基因组证据及低分化背景的形成机制。
文件详解
- 文件名称:README_for_RADsysBio_Scripts.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:RADsysBio脚本的说明文档,提供脚本使用相关指导
- 文件名称:Monarcha_nexus_files.tar.gz
- 文件格式:GZ
- 字段映射介绍:Nexus格式文件压缩包,可能包含系统发育分析相关数据
- 文件名称:dadiScripts.tar.gz
- 文件格式:GZ
- 字段映射介绍:dadi分析脚本压缩包,用于种群遗传学模型拟合分析
- 文件名称:RADsysBio_Scripts.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:RADsysBio相关脚本压缩包,用于基因组分化分析
数据来源
论文“Genomic evidence for convergent evolution of a key trait underlying divergence in island birds”
适用场景
- 岛屿鸟类基因组分化研究: 分析栗腹王鹟种群间基因组分化模式及关键性状相关基因作用
- 趋同进化机制分析: 探究黑化种群趋同进化的基因组证据及进化路径
- 种群遗传学模型拟合: 利用dadi脚本分析种群分化的历史动态及基因流情况
- 基因组分化分析工具应用: 通过RADsysBio脚本开展基因组分化相关计算与验证