数据集概述
该数据集围绕墨西哥跨墨西哥火山带分布的山地丛生草蜥蜴Sceloporus subniger的隐秘多样性展开,包含线粒体DNA、UCE基因组数据及形态学测量结果,用于验证该物种是否为复合种,支持新物种描述的遗传与形态学证据。
文件详解
- README_mtDNA.pdf:PDF格式文档,可能包含线粒体DNA(mtDNA)数据集的实验方法、样本信息及分析说明
- README_SNPs.pdf:PDF格式文档,可能包含单核苷酸多态性(SNPs)相关数据的处理流程与结果解释
- subnigerSTRUCTURE.txt:TXT格式文件,可能为群体遗传结构分析(STRUCTURE软件)的输入或输出数据,包含样本编号及基因型数据
- subnigerSNAPP.nex:NEX格式文件,可能用于SNAPP(物种树推断工具)分析的输入数据,包含基因组位点信息
- subnigerND4.nex:NEX格式文件,可能为线粒体ND4基因序列数据,用于系统发育分析
- subniger_tRNAs.txt:TXT格式文件,可能包含线粒体转运RNA(tRNAs)序列数据或注释信息
适用场景
- 爬行动物系统分类学研究:分析Sceloporus subniger物种复合体的分类地位与新物种界定
- 群体遗传学分析:探究墨西哥不同地理种群的遗传结构与分化模式
- 生物地理学研究:揭示跨墨西哥火山带对山地蜥蜴物种分布与演化的影响
- 基因组学方法应用:验证UCE与线粒体DNA联合分析在物种鉴定中的有效性