数据集概述
本数据集包含在癌细胞条件下,使用东京大学光谱仪B对耐高压细胞进行的mRaichu荧光光谱测量数据。数据覆盖不同浓度GAP结构域、GEF结构域及有无高压处理的实验条件,记录了不同时间点的测量结果。
文件详解
该数据集包含三百二十个目录及二百五十一个TXT格式文件,文件组织与内容说明如下:
- 目录结构:按实验条件分层,例如主目录为mRaichu data under HP with various GAP domain and GEF domain (for Cancer CELL condition)/,次级目录按GAP与GEF浓度分组(如a cDT +0.1 µM GAPd +0.1 µM GEFd/),三级目录按具体实验样本分组(如a1 Raichu DTc +A01 +E001 +h/)。
- 文件命名规则:
- 文件名包含时间点(如0min.txt、2min.txt)、重复标识(如0min b.txt)
- 目录名中+h表示该组数据在静水压下测量
- 目录名包含GAP结构域浓度(如+0.1 µM GAPd)、GEF结构域浓度(如+0.1 µM GEFd)等实验参数
- 文件内容示例:
- 2min.txt:记录实验进行至两分钟时的荧光光谱数据
- 文件头部包含元数据,如测量日期、时间、光谱仪分辨率、波长范围等(如TITLE DATA TYPE ORIGIN JASCO OWNER DATE 22/11/11 TIME 10:14:30 SPECTROMETER/DATA SYSTEM RESOLUTION DELTAX 1 XUNITS NANOMETERS YUNITS INTENSITY FIRSTX 450.0000 LASTX 650.0000 NPOINTS)
数据来源
东京大学
适用场景
- 细胞生物学研究:分析高压环境下癌细胞中GAP与GEF结构域对mRaichu(GDP/GTP结合状态)的调控机制
- 生物物理实验:研究静水压对蛋白质相互作用及细胞信号通路的影响
- 癌症相关药物研发:探索GAP/GEF结构域作为潜在药物靶点的可能性
- 荧光光谱数据分析:验证高压条件下生物分子荧光特性的变化规律