数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)AQ1033品系(携带mec-7(u448)突变及pmec-4::YC2.12转基因)的行为实验数据,记录了成虫在特定培养条件下的运动行为特征,包含实验设计参数、视频分析结果及特征数据文件,是研究线虫机械感知相关基因功能的基础数据。
文件详解
- 行为特征数据文件:
- 文件名称:mec-7 (v448) on food L_2010_10_01__12_07_2482_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、骨架结构等分析结果
- 原始分析数据文件:
- 文件名称:mec-7 (v448) on food L_2010_10_01__12_07_2482.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验视频的原始分析数据,如帧信息、像素映射参数等
- 压缩行为数据文件:
- 文件名称:mec-7 (v448) on food L_2010_10_01__12_07_2482.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式记录运动行为序列
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经行为研究:分析mec-7基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 基因功能验证:探究机械感知相关基因在行为调控中的作用机制
- 行为学实验方法优化:基于标准化实验流程(Yemini et al.方法)验证线虫行为分析的可重复性
- 生物信息学工具应用:测试tierpsy等行为分析软件在模式生物行为数据处理中的性能
- 神经科学基础研究:结合转基因标记(pmec-4::YC2.12)研究机械感受神经元与行为的关联