数据集概述
本数据集是论文“mRNA lipid nanoparticle phase transition”的模拟输入文件与数据，包含周期性膜片、脂质纳米颗粒的平衡结构及拓扑参数文件，覆盖不同pH条件、脂质类型、mRNA修饰状态下的5类系统（A-G）模拟数据，用于研究mRNA脂质纳米颗粒的相变机制，总计包含1个压缩文件。
文件详解
- 压缩文件
- 文件名称：
Archiv.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容分类：
- 周期性膜片（periodic_patches）：含low_ph（单/四重复膜片）、dspc_chol、neutral_ph、mRNA_selfassembly（自组装及3组去质子化模拟系统）的平衡结构、.mdp和.top文件
- 脂质纳米颗粒（nanoparticles）：含lnp_nopegs（带帽PEG化脂质）、lnp_pegs（完整PEG化脂质）的平衡结构、.mdp和.top文件
- 拓扑文件（topology）：含DSPC、CHOL、ALC系列脂质（ALC-0159、ALC-0315质子化/中性）、修饰mRNA的CHARMM36力场参数文件
数据来源
论文“mRNA lipid nanoparticle phase transition”（Trollmann, Marius F.W. and Böckmann, Rainer A.）
适用场景
- 生物物理相变机制研究：分析mRNA脂质纳米颗粒在不同pH、脂质组成下的相变过程与结构变化
- 脂质纳米颗粒设计优化：基于模拟数据优化mRNA递送系统的脂质成分（如PEG化程度、质子化状态）
- 分子动力学模拟参数验证：使用拓扑文件复现或扩展mRNA脂质纳米颗粒的分子动力学模拟
- 核酸递送系统机制解析：探究mRNA与脂质自组装及去质子化对纳米颗粒稳定性的影响
