数据集概述
本数据集是支持论文《MSC1 Cells Suppress Colorectal Cancer Cell Growth via Metabolic Reprogramming, Laminin–Integrin Adhesion Signaling, Oxidative Stress Resistance, and a Tumor-Suppressive Secretome》的补充数据，包含LPS激活TLR4后WJ-MSCs中蛋白质相互作用（PPI）及转录因子（TF）靶基因分析的Excel格式文件，可用于复现相关生物信息学分析。
文件详解
该数据集包含四个Excel格式文件，具体说明如下：
- STRING_Input_Protein_List-for_PPI_Network_Construction.xlsx：Excel格式，收录文献报道的LPS刺激TLR4后的下游效应蛋白列表，用于构建蛋白质相互作用网络。
- PPI_Network_from_STRING-Downstream_of_TLR4_Activation.xlsx：Excel格式，基于上述蛋白列表通过STRING生成的蛋白质相互作用网络数据，包含相互作用评分及网络指标。
- MCODE_Clusters-In_PPI_Network_Downstream_of_TLR4_Activation_by_LPS.xlsx：Excel格式，通过Cytoscape的MCODE插件从PPI网络中识别的模块聚类数据，包含聚类ID及组成蛋白。
- WJ-MSC_Expressed-TF_Target_Genes-of_Enriched_TF_Targets_in_PPI_Network_Downstream_of_TLR4_Activation_By_LPS.xlsx：Excel格式，收录PPI网络中富集的转录因子靶基因（来自MSigDB）且在WJ-MSCs中表达的基因列表，包含基因名称、功能、基因组位置及Uniprot注释的GO术语。
适用场景
- 生物信息学研究：复现TLR4激活下游的蛋白质相互作用网络构建与模块聚类分析。
- 转录调控研究：分析WJ-MSCs中TLR4通路相关的转录因子靶基因表达特征。
- 肿瘤生物学研究：探究MSC1细胞抑制结直肠癌的分子机制中TLR4信号通路的作用。
- 计算生物学方法验证：验证STRING、MCODE等工具在蛋白质网络分析中的应用效果。
