数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT1067品系(携带egl-31(n472)I基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨培养基上进行,使用tierpsy软件追踪线虫运动,包含特征数据、原始数据和wcon格式压缩文件三类文件,用于研究该基因突变对线虫行为的影响。
文件详解
- 特征数据文件
- 文件名称:egl-31 (n472)I on food R_2010_07_15__14_35_3849_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,基于tierpsy软件追踪的19479个分段骨架提取,涉及运动轨迹、姿态等行为特征。
- 原始数据文件
- 文件名称:egl-31 (n472)I on food R_2010_07_15__14_35_3849.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始追踪数据,包含视频帧对应线虫的位置、骨架等基础信息。
- wcon格式压缩文件
- 文件名称:egl-31 (n472)I on food R_2010_07_15__14_35_3849.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据,符合线虫行为数据交换标准格式。
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析egl-31(n472)I基因突变对线虫成年阶段行为模式的影响。
- 行为学数据分析方法验证:基于tierpsy软件提取的特征数据,验证线虫行为特征提取算法的有效性。
- 模式生物行为标准化研究:利用wcon格式数据,参与线虫行为数据的标准化交换与整合分析。
- 实验室行为实验复现:依据实验参数(如培养条件、追踪方法)复现类似线虫行为实验,对比不同基因或环境因素的影响。