数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了MT1082品系egl-1(n487)V基因突变型成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频原始数据、特征提取数据及标准化格式数据,共3个文件。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:
egl-1 (n487)V on food R_2010_07_09__11_25_24___4___3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含19787个分割骨架数据,对应898.17秒实验时长、25.641帧/秒帧率
- 特征提取文件
- 文件名称:
egl-1 (n487)V on food R_2010_07_09__11_25_24___4___3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据
- 标准化格式文件
- 文件名称:
egl-1 (n487)V on food R_2010_07_09__11_25_24___4___3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为线虫行为数据的标准化wcon格式文件,便于跨平台共享分析
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)William R Schafer实验室
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析egl-1(n487)V基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 神经生物学实验验证: 验证特定基因调控下的线虫运动、觅食等行为模式
- 行为分析算法测试: 基于标准化wcon格式数据测试或优化线虫行为追踪算法
- 分子生物学实验复现: 参考实验方案(如30分钟适应期、tierpsy软件参数)复现线虫行为实验