数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了MT1216品系(egl-9(n586)V突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的行为实验数据,包含实验条件、视频参数及行为特征文件,用于研究egl-9基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:
egl-9 (n586)V on food R_2010_07_16__12_46_00___8___8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,具体字段未详细说明,推测包含基于tierpsy软件提取的运动轨迹、骨架特征等行为参数
- 文件名称:
egl-9 (n586)V on food R_2010_07_16__12_46_00___8___8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据文件,通常包含时间序列的运动坐标、速度等行为记录
- 文件名称:
egl-9 (n586)V on food R_2010_07_16__12_46_00___8___8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始或处理后的核心数据,具体字段未详细说明,推测包含视频帧对应的线虫形态、位置等基础数据
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析egl-9(n586)V突变体与野生型线虫的行为差异,探究egl-9基因对行为的调控作用
- 行为表型分析: 基于提取的运动轨迹、骨架特征等数据,研究线虫的运动模式、觅食行为等表型特征
- 实验方法验证: 参考Yemini等人的实验方法,验证秀丽隐杆线虫行为实验的标准化流程
- 生物信息学工具应用: 基于tierpsy软件提取的特征数据,开发或优化线虫行为分析算法