数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了egl-6(n592)X基因变异株(品系MT1222)的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,通过Tierpsy软件采集并分析线虫的运动行为,包含原始视频处理数据、特征提取数据等,可用于研究该基因变异对线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据文件
- 文件名称:
egl-6 (n592)X on food R_2010_05_13__15_47___3___13.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始采集与处理数据,包含视频帧对应的线虫骨架分割等基础信息
- 特征数据文件
- 文件名称:
egl-6 (n592)X on food R_2010_05_13__15_47___3___13_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含从行为数据中提取的线虫运动特征参数,用于量化分析行为模式
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:
egl-6 (n592)X on food R_2010_05_13__15_47___3___13.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,包含标准化的行为记录格式
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析egl-6(n592)X基因变异对线虫运动行为的影响,探究该基因在行为调控中的作用
- 行为学实验方法验证: 参考实验方案(如培养条件、采集参数),优化线虫行为实验的标准化流程
- 生物图像分析算法测试: 利用数据集的骨架分割、特征提取结果,验证或改进线虫行为分析算法
- 基因-行为关联分析: 结合基因变异信息与行为特征数据,构建基因功能与表型的关联模型