数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT1236品系(携带egl-40(n606)IV突变)的行为实验数据,包含成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂环境中的行为记录。数据由tierpsy软件采集处理,涵盖视频原始数据、特征提取结果等,可用于分析该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:
egl-40 (n606)IV on food R_2010_08_06__12_55_22___6___7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始数据及基础记录信息
- 特征数据文件
- 文件名称:
egl-40 (n606)IV on food R_2010_08_06__12_55_22___6___7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取结果,涉及14042个分段骨架等行为特征数据
- 压缩数据文件
- 文件名称:
egl-40 (n606)IV on food R_2010_08_06__12_55_22___6___7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的行为数据相关文件
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)William R Schafer实验室;秀丽隐杆线虫行为数据库(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析egl-40基因突变对秀丽隐杆线虫运动、觅食等行为的影响机制
- 生物行为特征提取: 基于tierpsy软件处理的特征数据,研究线虫行为量化分析方法
- 模式生物实验方法验证: 参考实验方案(如30分钟适应期、NGM琼脂环境设置)优化秀丽隐杆线虫行为实验设计
- 基因-行为关联分析: 探索egl-40基因与线虫特定行为表型的关联模式