数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT151品系egl-33(n151)I突变体线虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨琼脂培养基上进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频转换数据、特征数据及行为追踪数据,用于研究该基因突变体的行为特征。
文件详解
- 行为数据文件(wcon格式压缩包)
- 文件名称:egl-33 (n151)I on food R_2010_05_11__15_08_4369.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:存储线虫行为轨迹的标准化数据,包含时间序列的位置、姿态等行为参数
- 特征数据文件(hdf5格式)
- 文件名称:egl-33 (n151)I on food R_2010_05_11__15_08_4369_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取结果,如运动速度、弯曲频率等量化指标
- 追踪数据文件(hdf5格式)
- 文件名称:egl-33 (n151)I on food R_2010_05_11__15_08_4369.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储原始视频追踪的结构化数据,包含19863个分段骨架数据,帧率为25.641帧/秒,视频像素对应4.33523微米
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析egl-33(n151)I突变体与野生型线虫的行为差异,探究该基因对行为的调控机制
- 行为表型分析:通过量化的行为特征数据,研究基因突变体的运动模式、觅食行为等表型变化
- 实验方法验证:验证使用tierpsy软件进行线虫行为追踪的实验方法可靠性
- 生物信息学分析:整合多组线虫行为数据,建立行为特征与基因功能的关联模型