数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫MT1540品系(基因型egl-36(n728)X)的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养皿中的运动行为。数据包含视频跟踪原始结果与特征提取文件,支持线虫行为表型的定量分析,属于C.elegans行为数据库的一部分。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:egl-36 (n728)X on food L_2010_07_23__12_54_2729.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的标准化数据文件(WCON格式),记录线虫运动的时空坐标等核心行为参数
- 特征提取文件
- 文件名称:egl-36 (n728)X on food L_2010_07_23__12_54_2729_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征,包括运动速度、弯曲度、身体姿态等定量指标
- 原始跟踪数据文件
- 文件名称:egl-36 (n728)X on food L_2010_07_23__12_54_2729.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含视频跟踪的原始数据,如26857个分段骨架数据、帧速率(30.03帧/秒)、像素-微米转换系数(4.49333微米/像素)等元数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经遗传学研究: 分析egl-36基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究离子通道基因在神经调控中的作用
- 行为表型定量分析: 利用特征文件中的运动参数,建立线虫行为表型的量化标准与分析模型
- 药物筛选与毒性测试: 作为正常/突变体线虫行为基线数据,支持药物或环境因子对行为影响的对比研究
- 行为跟踪算法验证: 基于已知基因型的行为数据,验证自动化跟踪软件(如tierpsy)的准确性与可靠性
- 神经生物学教学示范: 用于展示模式生物行为实验的设计、数据采集与分析流程