数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT15434品系tph-1(mg280)II基因突变体成虫的行为实验数据。实验于2009年12月14日开展,包含线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的行为轨迹及特征数据,采用tierpsy软件采集分析,可用于研究tph-1基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 特征数据文件
- 文件名称:tph-1 superoutcrossed on food R_2009_12_14__14_46_59110_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取数据,具体字段基于tierpsy软件的行为分析模块生成
- 行为轨迹文件
- 文件名称:tph-1 superoutcrossed on food R_2009_12_14__14_46_59110.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为轨迹的原始采集数据,包含时间序列的位置及运动参数
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:tph-1 superoutcrossed on food R_2009_12_14__14_46_59110.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的线虫行为数据文件,包含标准化的行为记录数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 神经生物学研究:分析tph-1基因突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 模式生物行为学实验:验证tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为分析中的应用效果
- 基因功能研究:探究色氨酸羟化酶编码基因tph-1与线虫行为表型的关联
- 实验方法学参考:参考E.Yemini等人的实验方案(doi:10.1038/nmeth.2560)开展同类研究