数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT2611菌株(unc-8(n491n1192)IV基因突变体)的行为实验数据。实验于2010年4月8日开展,使用tierpsy软件追踪成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂平板上的行为,包含视频处理后的骨架分割、特征提取等数据,共3个文件。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:unc-8 rev on food L_2010_04_08__15_14_3849.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始或标准化数据(wcon格式),具体字段需解压后查看
- 核心行为数据文件
- 文件名称:unc-8 rev on food L_2010_04_08__15_14_3849.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的基础数据,包含19245个分段骨架信息,关联总时长(898.386秒)、帧率(25.5102帧/秒)、像素分辨率(4.7068微米/像素)等参数
- 特征提取数据文件
- 文件名称:unc-8 rev on food L_2010_04_08__15_14_3849_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,具体特征字段需结合软件版本(cbfc23eb4f1ac2f29be75ade7a937eed58a5b219)解析
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(William R Schafer实验室)
适用场景
- 线虫基因突变体行为分析: 研究unc-8基因对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 分子神经生物学研究: 探索unc-8基因在神经肌肉功能调控中的作用机制
- 行为实验方法验证: 基于E. Yemini等的实验方法,验证线虫行为追踪技术的重复性
- 模式生物行为数据库构建: 补充秀丽隐杆线虫行为数据库的基因突变体实验数据
- 生物图像分析算法优化: 利用骨架分割和特征提取数据,优化线虫行为追踪软件的算法性能