数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了MT7988菌株(基因型bas-1(ad446)III)成年雌雄同体个体在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据,包含视频追踪的原始与处理后文件,用于研究该基因相关的行为表型。
文件详解
- 行为特征数据文件:
bas-1 (ad446)III on food R_2009_12_14__13_01_23___1___9_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的特征数据,基于tierpsy软件提取的20147个分段骨架信息,可能涵盖运动轨迹、速度、体态等行为特征
- 原始追踪数据文件:
bas-1 (ad446)III on food R_2009_12_14__13_01_23___1___9.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验的原始追踪数据,包含视频像素与实际长度的映射(4.67178微米/像素)、帧率(25.641帧/秒)等基础参数
- 行为数据压缩文件:
bas-1 (ad446)III on food R_2009_12_14__13_01_23___1___9.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,遵循wcon格式标准,可能包含结构化的行为时间序列数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析bas-1基因(ad446等位基因)对秀丽隐杆线虫成年个体行为表型的影响
- 神经生物学实验:探究基因变异与线虫运动、觅食等行为的关联机制
- 行为数据分析方法验证:基于标准化的实验数据测试行为特征提取算法的有效性
- 模式生物行为数据库补充:为秀丽隐杆线虫行为数据库提供具体基因的实验案例数据