MT7988_bas_1_C_elegans行为实验数据_2009_12_17

数据集概述

本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了MT7988品系(携带bas-1(ad446)III突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2009年12月17日在英国MRC分子生物学实验室完成,采用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,使用tierpsy软件追踪分析线虫行为,包含原始追踪、特征提取及标准化格式的三类文件。

文件详解

  • 原始追踪数据文件
  • 文件名称:bas-1 (ad446) on food R_2009_12_17__15_52_32___6___9.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含19389个分割骨架信息,对应实验总时长899.388秒、帧率25.8398帧/秒、像素分辨率4.4944微米/像素
  • 特征提取数据文件
  • 文件名称:bas-1 (ad446) on food R_2009_12_17__15_52_32___6___9_features.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取结果,由tierpsy软件(版本cbfc23eb4f1ac2f29be75ade7a937eed58a5b219)生成
  • 标准化行为数据文件
  • 文件名称:bas-1 (ad446) on food R_2009_12_17__15_52_32___6___9.wcon.zip
  • 文件格式:ZIP(含WCON格式文件)
  • 字段映射介绍:压缩存储符合WCON标准的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析

数据来源

C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org

适用场景

  • 线虫遗传学研究:分析bas-1基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
  • 行为学实验方法验证:基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为追踪技术的重复性与可靠性
  • 神经生物学机制研究:通过行为特征数据探究单胺类神经递质相关基因(bas-1)的功能
  • 模式生物行为数据库补充:为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的突变体行为数据支撑
  • 计算机视觉在生物研究中的应用:验证tierpsy软件在线虫行为追踪与特征提取中的性能
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 381.52 MiB
最后更新 2026年1月19日
创建于 2026年1月19日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。