苜蓿属基因组系统发育信号变异数据集

数据集概述

该数据集包含29种苜蓿属(豆科)植物的全基因组序列数据,通过与蒺藜苜蓿参考基因组比对,获得八万七千五百九十六个可变同源位点。用于解析苜蓿属内系统发育关系、评估不同位点数量的系统发育信号强度,以及识别与全基因组系统发育冲突的基因组区域。

文件详解

该数据集包含12个文件,具体说明如下: - 系统发育数据文件(.phy格式,共9个): - chl_29_ab.phy:叶绿体相关的29个分类群系统发育数据 - chr1_29_ab.phy:1号染色体的29个分类群系统发育数据 - chr2_29_ab.phy:2号染色体的29个分类群系统发育数据 - chr3_29_ab.phy:3号染色体的29个分类群系统发育数据 - chr5_29_ab.phy:5号染色体的29个分类群系统发育数据 - chr7_29_ab.phy:7号染色体的29个分类群系统发育数据 - chr8_29_ab.phy:8号染色体的29个分类群系统发育数据(注:原文件样本中未列出chr4、chr6相关文件) - 图表文件(.pdf格式,共3个): - figS01-MB-PA_comp.pdf:MB与PA方法比较的补充图表1 - figS02-chromtrees_MBcon_r02.pdf:染色体树MB一致性的补充图表2 - figS03-recurrent_conflict4_r04.pdf:重复冲突分析的补充图表3

适用场景

  • 豆科植物系统发育研究:解析苜蓿属内物种间的进化关系
  • 基因组进化分析:探究系统发育信号在不同基因组区域的变异规律
  • 分子系统学方法评估:比较不同位点数量对系统发育估计准确性的影响
  • 物种分化机制研究:分析近期分化类群中深度共祖或基因渐渗的基因组证据
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.56 MiB
最后更新 2025年12月23日
创建于 2025年12月23日
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