数据集概述
本数据集为抗抑郁药暴露甲基化组关联研究（MWAS）的结果数据，包含全人群及重度抑郁症（MDD）亚组中处方与自报抗抑郁药暴露的MWAS汇总统计，以及下游功能分析（差异甲基化区域、通路富集、组织富集等）和甲基化谱评分数据，共18个文件，支持抗抑郁药暴露的表观遗传学研究。
文件详解
- MWAS汇总统计文件（.moa格式）
- 全人群处方暴露：
GRM_unadjusted_antidep_pheno1_clean_appt_MOA_ORM_residph_standard_06_10.moa（n=7951）
- 全人群自报暴露：
GRM_unadjusted_selfrep_pheno3_MOA_ORM_residph_standard_06_10.moa（n=16531）
- MDD亚组处方暴露：
GRM_unadjusted_antidep_pheno2_clean_appt_MOA_ORM_residph_standard_06_10.moa（n=792）
- MDD亚组自报暴露：
GRM_unadjusted_selfrep_pheno4_MOA_ORM_residph_standard_06_10.moa（n=2268）
- 字段说明：包含甲基化位点与抗抑郁药暴露关联的统计量（如效应量、P值等）
- 差异甲基化区域分析文件（.tsv格式）
- 处方暴露：
antidep_pheno1_clean_appt_dmr_res.tsv
- 自报暴露：
selfrep_pheno3_dmr_res.tsv
- 字段说明：包含染色体位置、甲基化差异统计量（B值、S值、P值等）
- 通路富集分析文件
- GO生物通路（.txt格式）：
gtex_v8_ts_DEG_PD.txt（处方）、gtex_v8_ts_DEG_SR.txt（自报），含基因集富集统计
- SynGo通路（.xlsx格式）：处方暴露对应
syngo_annotations_matching_user_input_PD.xlsx和syngo_ontologies_with_annotations_matching_user_input_PD.xlsx；自报暴露对应同名_SR文件，含通路注释与本体信息
- 甲基化谱评分文件：
GS_AD_MRS_weights.txt（.txt格式），含抗抑郁药暴露甲基化谱评分权重
- 图表源数据文件：
source_data.xlsx（.xlsx格式），包含非个体水平的图表及补充图表源数据
数据来源
论文“Insights from a Methylome-Wide Association Study of Antidepressant Exposure”
适用场景
- 表观遗传学研究：分析抗抑郁药暴露与全基因组甲基化位点的关联模式
- 精神疾病表观机制探索：研究MDD患者抗抑郁药暴露的甲基化特征差异
- 功能基因组学分析：通过差异甲基化区域和通路富集数据，解析抗抑郁药暴露的分子通路机制
- 生物标志物开发：基于甲基化谱评分数据，探索抗抑郁药反应相关的表观遗传标志物
- 医学研究数据支撑：为抗抑郁药疗效及安全性的表观遗传学机制研究提供基础数据
