南美亚马逊以南树蛙生物地理历史与多样化数据集

数据集概述

本数据集围绕南美亚马逊以南树蛙类群(Boana pulchella group)的生物地理历史与多样化展开,涵盖物种系统发育、祖先分布区重建、栖息地转移分析及多样化模型评估等研究内容,为理解区域物种组装与演化提供数据支持。

文件详解

  • 系统发育树文件:
  • hyptree_R.tre:TRE格式文件,包含Boana pulchella类群的时间校准系统发育树
  • 生物地理分析输入文件:
  • input_BioGeoBEARS.txt:TXT格式文件,用于BioGeoBEARS分析的输入数据
  • 扩散系数文件:
  • manual_dispersal_multipliers_M1.txt、manual_dispersal_multipliers_M2.txt、manual_dispersal_multipliers_M3.txt、manual_dispersal_multipliers_M4.txt、manual_dispersal_multipliers_M5.txt:TXT格式文件,包含不同扩散场景下的区域间扩散系数矩阵
  • 分析代码文件:
  • BioGeoBEARS_model_selection_&_BSM.R:R格式文件,用于生物地理模型选择和随机映射分析的代码
  • 多样化分析报告文件:
  • rpanda_pulchella_group.html:HTML格式文件,可能包含rpanda多样化分析的结果报告

适用场景

  • 生物地理学研究:分析南美亚马逊以南地区树蛙类群的祖先分布区与扩散路径
  • 物种多样化机制研究:探究古气候、栖息地转移对树蛙类群物种形成与灭绝速率的影响
  • 生态演化分析:评估不同生态区(如森林与开阔生境)对树蛙物种组装的作用
  • 系统发育方法应用:验证时间校准系统发育树构建及生物地理模型选择的有效性
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.87 MiB
最后更新 2025年12月10日
创建于 2025年12月10日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。