数据集概述
本数据集包含南美籽粒苋（Amaranthus caudatus）及其野生近缘种A. hybridus、A. quitensis的基因组与表型数据，用于研究该作物的不完全驯化特征。通过基因分型测序（GBS）获得9485个SNP位点，分析遗传分化、多样性及种子大小、颜色等驯化性状，揭示其弱驯化综合征的遗传机制。
文件详解
- README_for_data_and_scripts.zip.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据及脚本的说明文件，包含分析步骤、目录结构及文件用途的概述
- data_and_scripts.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含主要分析文件，如'filtered_snps_60_missing_noL2BA80.vcf'（核心SNP数据文件）、'adegenet'目录（用于adegenet分析的输入文件）、分析脚本及中间文件
数据来源
论文“Genomic and phenotypic evidence for an incomplete domestication of South American grain amaranth (Amaranthus caudatus)”
适用场景
- 植物驯化遗传学研究: 分析南美籽粒苋与野生近缘种的遗传分化及驯化性状的基因组基础
- 作物进化研究: 探讨不完全驯化作物的遗传多样性、基因流及选择压力机制
- 农业育种应用: 利用遗传标记数据辅助籽粒苋的品种改良与驯化性状选择
- 生物多样性分析: 研究安第斯地区籽粒苋野生近缘种的地理分布与遗传结构
