数据集概述
本数据集包含脑源性Abeta42纤维的二维固态核磁共振(NMR)谱文件及分子动力学(MD)模拟轨迹文件,涵盖不同类型纤维的结构数据,为研究阿尔茨海默病相关蛋白纤维结构提供实验与模拟支持。
文件详解
- 固态NMR谱文件(.ucsf格式):共七个文件,包含2D NCACX、NCA、CC等类型谱图,如2DNCACX_Ab42_18kHz_1004.ucsf、Ab42-FGAILM_2D_NCA_2nd_gen.ucsf等,记录不同标记条件下纤维的核磁共振信号
- MD模拟轨迹文件:
- 结构文件(.psf格式):Ab42_typeA_out.psf、Ab42_typeB_out.psf,记录A/B型纤维的拓扑结构
- 轨迹文件(.dcd格式):Ab42_typeA_out.dcd、Ab42_typeB_out.dcd,记录200纳秒模拟过程中的原子运动轨迹
- 说明文档:README.txt,提供数据制备方法、纤维类型(初代/次代)、标记策略等背景信息
适用场景
- 蛋白质结构生物学研究:分析脑源性Abeta42纤维的原子级结构特征
- 阿尔茨海默病机制研究:探究纤维结构与病理相关性
- 分子动力学模拟验证:结合NMR实验数据优化蛋白纤维模拟模型
- 药物研发支撑:为靶向Abeta42纤维的药物设计提供结构参考