数据集概述
本数据集为论文“Interactions amplify cumulative effects in marine food webs”分析所用的输入数据存档,包含圣劳伦斯河口和海湾食物网累积效应评估的结构化数据,涵盖物种列表、营养敏感性、生物数据、交互网络、物种敏感性及环境驱动因子数据,支持海洋食物网相互作用与累积效应的研究。
文件详解
- 物种列表文件
- 文件名称:
SpeciesList.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:
species(物种完整学名)、Count(物种在数据集中的计数或频率)、sp(简化物种名,属种间空格分隔)、sp.(简化物种名,属种间句号分隔)、species.(属种用句号连接的完整学名)
- 营养敏感性文件
- 文件名称:
TrophicSensitivity.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:
pathID(效应路径标识符)、SpeciesID(物种唯一标识)、motifID(营养网络中的基序标识)、Species(路径中物种的简写标签)、pi/pj/pk(物种在路径中i/j/k位置的存在标识,布尔值)、sensitivity_original(原始敏感性值)、sensitivity_scaled(标准化敏感性值)、sensitivity_1(特定分析场景的调整后敏感性值)
- 生物数据文件
- 文件名称:
txNames.csv(分类单元名称列表)、bt.csv(物种存在逻辑矩阵)、idBiotic.csv(生物数据单元格标识)、r.tif(参考空 raster 文件)、biotic/(各物种 GeoTIFF 文件文件夹)
- 文件格式:CSV、TIFF、文件夹
- 字段映射介绍:
bt.csv含每个 raster 单元格对应各物种的存在状态;biotic/内为单个物种的地理空间 raster 数据
- 元网络文件
- 文件名称:
metaweb.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:以物种名为行列名的交互矩阵,代表物种间的营养链接关系
- 物种敏感性文件
- 文件名称:
species_sensitivity.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:以分类单元名为行、驱动因子名为列的矩阵,记录各物种对环境驱动因子的敏感性(浮游植物和浮游动物默认对所有驱动因子不敏感)
- 驱动因子数据文件
- 文件名称:
dr.csv(驱动因子强度矩阵)、drivers/(各驱动因子 GeoTIFF 文件文件夹)
- 文件格式:CSV、文件夹
- 字段映射介绍:
dr.csv含每个 raster 单元格对应各驱动因子的强度值;drivers/内为单个驱动因子的地理空间 raster 数据
数据来源
GitHub 仓库:https://github.com/Ecosystem-Assessments/nceastl
适用场景
- 海洋食物网累积效应评估:分析物种间相互作用如何放大海洋食物网的累积效应
- 营养敏感性研究:基于营养网络基序和路径,探究物种对不同营养驱动因子的敏感性差异
- 海洋生态驱动因子分析:结合环境驱动因子与物种敏感性数据,评估驱动因子对食物网的影响
- 海洋生物地理分布研究:利用生物数据的 raster 文件,分析圣劳伦斯河口和海湾物种的空间分布特征
- 生态系统模型构建:通过元网络、物种列表等数据,构建区域海洋食物网的生态系统模型