数据集概述
本数据集为RNAseq数据，围绕内皮素受体拮抗剂HJP272对癌细胞迁移和侵袭的作用展开，包含测序原始数据、分析结果及说明文档，覆盖从质控到富集分析的全流程，为探究HJP272的分子机制提供数据支持。
文件详解
该数据集包含多个目录和文件，按功能分类说明如下：
- 项目信息文件:
- project_info.xls: XLS格式，存储项目基本信息
- result_tree.html、X202SC22073034-Z01-F001_report.html: HTML格式，项目结果概览报告
- 分析流程说明文档:
- SupFile.README.pdf、QC.README.pdf、Mapping.README.pdf、Quantification.README.pdf、DiffExprAnalysis.README.pdf、Enrichment.README.pdf: PDF格式，分别对应数据补充文件、质控、比对、定量、差异表达、富集分析环节的说明
- 分析结果文件:
- 质控结果: 位于1.QC目录下，包含错误率、GC含量等质控数据
- 比对结果: 位于2.Mapping目录下，记录基因序列比对信息
- 定量结果: 位于3.Quant目录下，包含基因表达量数据
- 差异表达分析结果: 位于4.Differential目录下，记录差异表达基因信息
- 富集分析结果: 位于5.Enrichment目录下，包含GO、KEGG、Reactome、DisGeNET等数据库的富集分析结果（如GSEA分析的index.html、图表文件等）
- 可视化结果: 包含SVG、PNG格式的柱状图、箱线图、PCA图等（如A549H100vsA549M.all_GObar.svg、boxplot.svg）
- 补充数据文件:
- kegg.xls、ko.xls、ppi.xls: XLS格式，存储KEGG通路、KO注释、蛋白互作数据
- Upstream_Geneseq.fa、Downstream_Geneseq.fa: FA格式，基因上下游序列
- GO_classification_count.txt: TXT格式，GO分类计数数据
适用场景
- 分子生物学研究: 分析HJP272对癌细胞基因表达谱的影响
- 肿瘤学研究: 探究HJP272抑制癌细胞迁移和侵袭的分子机制
- 药物研发: 评估HJP272作为抗癌药物的潜在价值
- 生物信息学分析: 用于RNAseq数据处理流程的参考案例
- 富集分析应用: 研究差异表达基因的功能注释及通路富集情况
