NEMBASE4_Based线虫转录组资源功能注释数据

数据集概述

本数据集为线虫转录组资源NEMBASE4的补充数据,包含六十余种线虫(含寄生与自由生活类群)的EST组装转录本、蛋白序列及功能注释信息,支持线虫转录组比较分析、寄生表型相关基因鉴定等研究,含补充信息压缩包与说明文档。

文件详解

  • Supplementary_Information.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容说明:包含NEMBASE4相关的补充文件,如Picornavirales RDRP比对、nanos锌指结构域比对、HemH/亚铁螯合酶蛋白比对等序列比对文件,线虫物种列表、候选水平转移基因部落等补充表格,以及强ylid类线虫nanos样锌指相关补充图。
  • README_for_Supplementary_Information.txt
  • 文件格式:TXT
  • 内容说明:NEMBASE4补充信息的说明文档,介绍补充文件的内容及用途。

数据来源

NEMBASE4: the nematode transcriptome resource

适用场景

  • 线虫转录组比较分析: 用于研究不同线虫类群(寄生/自由生活)的转录组差异与进化关系。
  • 寄生线虫表型相关基因鉴定: 识别寄生线虫谱系限制性基因,探究其对寄生表型的支撑作用。
  • 线虫功能基因注释研究: 利用蛋白序列及功能注释信息,分析线虫基因的功能与家族分类。
  • 线虫药物靶点挖掘: 基于线虫特有蛋白家族,筛选潜在药物靶点。
  • 水平基因转移研究: 通过候选水平转移基因部落数据,分析线虫的基因水平转移事件。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.2 MiB
最后更新 2026年1月30日
创建于 2026年1月30日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。