数据集概述
本数据集包含研究“新热带区预适应与适应塑造性状-环境匹配”所用的原始及最终数据,涉及156种Swartzia属分类群的地理分布记录、69个分类群的系统发育信息,以及叶、花瓣、果实性状数据,配套19个气候变量、土壤变量数据和性状提取脚本,共17个文件,用于分析植物性状与环境的匹配关系。
文件详解
- 系统发育相关文件
- Supplementary_file_1_BEAST_configuration_with_DNA_partitions.xml:XML格式,BEAST软件的DNA分区配置文件
- Supplementary_file_2_BEAST_raw_set_of_posterior_trees.trees:trees格式,BEAST生成的原始后验树集合
- Supplementary_file_3_Maximum_clade_credibility_tree_with_all_taxa_from_original_dataset:无扩展名,包含原始数据集所有分类群的最大分支可信度树
- Supplementary_file_4_Maximum_clade_credibility_tree_pruned_to_one_taxa_per_species_or_varieties:无扩展名,精简为每个物种/变种一个分类群的最大分支可信度树
- Supplementary_file_5_1000_Posterior_trees_sampled_and_pruned_to_one_taxa_per_species_or_varieties.trees:trees格式,抽样并精简后的1000棵后验树
- 地理分布文件
- Supplementary_file_6_Swartzia_records_with_at_least_5_occurrences_per_taxa.xlsx:XLSX格式,每个分类群至少5条分布记录的数据集
- 性状原始数据文件
- Supplementary_file_7_leaflet_raw_dataset_with_synonym_species_and_references.xlsx:XLSX格式,含同物异名及参考文献的叶原始数据集
- Supplementary_file_8_fruit_raw_dataset_with_synonym_species_and_references.xls:XLS格式,含同物异名及参考文献的果实原始数据集
- Supplementary_file_9_petal_raw_dataset_with_synonym_species_and_references.xls:XLS格式,含同物异名及参考文献的花瓣原始数据集
- Supplementary_file_11_leaflet_complement_herbaria_measurements.xlsx:XLSX格式,叶标本补充测量数据
- Supplementary_file_12_fruit_complement_herbaria_measurements.xlsx:XLSX格式,果实标本补充测量数据
- 性状-环境整合数据文件
- Supplementary_file_13_leaflet_climate_and_soil_averaged_dataset_per_taxa.csv:CSV格式,每个分类群的叶性状与气候、土壤平均数据集
- Supplementary_file_14_fruit_climate_and_soil_averaged_dataset_per_taxa.csv:CSV格式,每个分类群的果实性状与气候、土壤平均数据集
- Supplementary_file_15_petal_climate_and_soil_averaged_dataset_per_taxa.csv:CSV格式,每个分类群的花瓣性状与气候、土壤平均数据集
- 代码与文档文件
- Supplementary_file_10_script_to_extract_trait_information_from_the_monograph_of_Richard_Cowan.R:R格式,从Richard Cowan专著提取性状信息的脚本
- README.md:MD格式,数据集标题、摘要等说明文档
- Supplementary_file_16_license_and_credits_on_photographs_used_for_figure_3.xlsx:XLSX格式,图3所用照片的许可与致谢信息
数据来源
论文“Pre‐adaptation and adaptation shape trait‐environment matching in the Neotropics”(DOI: 10.1111/geb.13730)
适用场景
- 植物性状-环境匹配分析:利用整合数据集研究Swartzia属性状与气候、土壤变量的关联
- 植物系统发育研究:基于系统发育树文件分析Swartzia属的演化关系
- 生物地理学研究:通过地理分布数据探究Swartzia属在新热带区的分布格局
- 植物功能性状研究:结合原始性状数据与补充测量数据,分析叶、花瓣、果实性状的变异规律
- 生态学模型训练:以性状-环境数据为基础,构建植物分布或适应性相关的预测模型