NetView_P_Based基因组SNP群体结构网络分析数据集

数据集概述

本数据集为NetView P工具的分析数据,该工具通过基于互k近邻阈值的群体网络构建,结合数据质量控制,分析基因组SNP的复杂群体遗传结构。支持模拟系谱、银唇珍珠牡蛎、欧洲无须鳕、北美灰狼等多类群体数据,可可视化大尺度与精细尺度的遗传结构及家族关系。

文件详解

  • 文件名称:oyster_data.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内包含银唇珍珠牡蛎群体的基因组SNP数据,具体字段需解压后查看,推测包含样本ID、SNP位点基因型等群体遗传分析核心字段,用于构建群体遗传网络。

适用场景

  • 群体遗传结构可视化:分析野生或圈养群体的大尺度与精细尺度遗传结构,识别群体间关系与家族层级结构。
  • 基因组SNP数据质量控制:验证NetView P工具在不同规模SNP数据(数百至数十万位点)中的质控效果。
  • 跨物种群体分析:支持模拟数据、珍珠牡蛎、欧洲无须鳕、灰狼等多物种群体的遗传网络构建与比较。
  • 开源群体分析工具拓展:作为NetView P工具的配套数据,用于测试工具的跨平台兼容性与多进程计算效率。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 47.73 MiB
最后更新 2026年1月28日
创建于 2026年1月28日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。