数据集概述
本数据集为酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的全局遗传互作网络数据，包含约100万对基因互作结果，涵盖约90%的酵母基因，其中负向互作约55万、正向互作约35万。数据通过自动化酵母遗传学实验构建，可用于分析基因功能关系、细胞模块架构及遗传网络规律。
文件详解
- 原始遗传互作数据集（Pair-wise格式）
- 文件名称：
Data File S1_Raw genetic interaction datasets - Pair-wise interaction format.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含酵母基因间成对遗传互作的原始数据
- 原始遗传互作数据集（Matrix格式）
- 文件名称：
Data File S2_Raw genetic interaction datasets - Matrix format.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：以矩阵形式存储的酵母基因遗传互作原始数据
- 遗传互作谱相似性矩阵
- 文件名称：
Data File S3_Genetic interaction profile similarity matrices.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：基于基因遗传互作谱计算的相似性矩阵数据
- GO生物过程功能预测数据
- 文件名称：
Data File S4_GO bioprocess functions predicted by the nonessential and essential similarity networks using a K-nearest neighbor approach.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：通过K近邻方法预测的非必需与必需基因网络的GO生物过程功能数据
- SAFE分析结果
- 文件名称：
Data File S5_SAFE analysis_Gene cluster identity and functional enrichments.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：基因聚类标识及功能富集的SAFE分析数据
- 高/低互作度基因数据
- 文件名称：
Data File S9_High and low interaction degree genes.xls
- 文件格式：XLS
- 字段映射介绍：具有高或低互作度的酵母基因列表数据
- Ipa1互作的质谱证据数据
- 文件名称：
Data File S8_Mass spectrometric evidence for Ipa1 interactions.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：支持Ipa1蛋白互作的质谱实验数据
- 蛋白复合物标准数据
- 文件名称：
Data File S12_Protein complex standard.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：酵母蛋白复合物的标准参考数据
- 蛋白复合物互作富集与偏差分析
- 文件名称：
Data File S15_Protein complex interaction enrichment and bias.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：蛋白复合物间互作富集程度及偏差的分析数据
- 查询菌株GI度相关性分析
- 文件名称：
Data File S10_Correlation analysis of query strain GI degree.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：查询菌株遗传互作（GI）程度的相关性分析数据
- 黑腹果蝇S2细胞 fitness数据
- 文件名称：
Data File S14_D. melanogaster S2 cell fitness.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：黑腹果蝇S2细胞的 fitness相关数据
数据来源
论文“A global genetic interaction network maps a wiring diagram of cellular function”
适用场景
- 基因功能关系分析: 通过遗传互作数据识别酵母基因间的功能关联，预测未知基因功能
- 细胞功能模块研究: 基于遗传互作谱相似性分析细胞内的功能模块架构
- 遗传网络规律探索: 探究酵母遗传网络中必需基因与非必需基因的互作特征及网络拓扑结构
- 蛋白复合物互作机制研究: 分析蛋白复合物间的遗传互作富集模式，揭示复合物功能关联
- 疾病遗传机制参考: 以酵母遗传网络为模型，为解析人类疾病的遗传互作机制提供参考
- 治疗靶点筛选: 利用负向遗传互作数据识别潜在的疾病治疗靶点
