数据集概述
该数据集围绕年龄依赖型物种形成模型展开,旨在解释经验系统发育树的形状特征。模型假设物种形成速率随物种年龄降低,可较好拟合TreeBase数据库中的数千棵系统发育树,为宏观进化中树不平衡问题提供了生物学合理的解释。
文件详解
- 文件名称: SupplementaryFigures1-10.pdf
- 文件格式: PDF
- 内容说明: 包含补充图表1至10,可能展示模型拟合结果、模拟树与经验树对比等可视化内容
- 文件名称: reliable_estimates_of_shape_on_simulated_phylogenies.zip
- 文件格式: ZIP压缩包
- 内容说明: 可能包含基于模拟系统发育树计算的形状可靠估计数据
- 文件名称: data-set_empirical_trees.zip
- 文件格式: ZIP压缩包
- 内容说明: 经验系统发育树数据集,可能为TreeBase数据库中的数千棵树的原始或处理后数据
- 文件名称: SupplementaryAnalyticResults.pdf
- 文件格式: PDF
- 内容说明: 补充分析结果文档,可能包含模型推导、统计检验等详细分析内容
- 文件名称: empirical_trees_parameter_estimation_based_on_simulated_trees.zip
- 文件格式: ZIP压缩包
- 内容说明: 基于模拟树的经验树参数估计数据,可能包含模型参数拟合结果、估计方法等
适用场景
- 宏观进化研究: 分析物种形成速率与物种年龄的关系,探究系统发育树不平衡的成因
- 进化模型验证: 验证年龄依赖型物种形成模型对经验系统发育树的拟合效果
- 系统发育树分析: 研究TreeBase数据库中数千棵经验树的形状特征与进化过程的关联
- 生物地理学研究: 探索新物种殖民新区域或生态位对物种形成速率的影响机制