数据集概述
本数据集为2021年发表的鸟蛤转录组研究配套数据，包含鸟蛤暴露于季节性腹泻性贝类毒素（DSTs）后的差异表达分析相关文件，涉及基因与转录本水平的表达计数、差异分析结果及可视化摘要等内容。
文件详解
该数据集包含以下文件，均通过OmicsBox v1.4.11或NOISeq v2.30.0生成：
- 基础序列文件：
- 47496_isoforms.box（.box格式）：含三万三千六百六十五个基因编码的四万七千四百九十六个开放阅读框（ORFs），用于差异表达分析中的转录本检索
- 表达计数文件：
- counts_genes.box、counts_isoforms.box（.box格式）：分别对应基因、转录本水平的表达计数表
- omicsbox_count_table_genes.txt、omicsbox_count_table_isoforms.txt（.txt格式）：分别对应基因、转录本水平的表达计数表
- 差异分析结果文件：
- ce_dge_vs_ce_dgc.box（.box格式）：鸟蛤消化腺暴露组与对照组的差异表达分析结果
- ce_ge_vs_ce_gc.box（.box格式）：鸟蛤鳃暴露组与对照组的差异表达分析结果
- normalized_counts_ce_dge_vs_ce_dgc.txt、normalized_counts_ce_ge_vs_ce_gc.txt（.txt格式）：分别对应消化腺、鳃差异分析的标准化计数
- 可视化摘要文件：
- relative_counts_per_category_[counts_isoforms].pdf（.pdf格式）：转录本/基因水平的相对计数可视化结果
- pairwise_differential_expression_wr_ce_dge_vs_ce_dgc.pdf、pairwise_differential_expression_wr_ce_ge_vs_ce_gc.pdf（.pdf格式）：分别对应消化腺、鳃差异表达分析的摘要报告
适用场景
- 海洋毒理学研究：分析腹泻性贝类毒素对鸟蛤基因表达的影响机制
- 转录组学分析：探究双壳类软体动物暴露于毒素后的分子响应路径
- 生态毒理学应用：评估贝类毒素对海洋生物的分子层面毒性效应
- 环境监测研究：为贝类养殖中腹泻性毒素的生物监测提供分子数据支撑
