数据集概述
本数据集包含NIH/3T3细胞seqFISH+实验中单个解码mRNA点的位置数据，以及实验相关的DAPI染色图像、细胞手动分割文件等辅助数据，为研究细胞内基因表达空间分布提供支持。
文件详解
- 核心实验数据文件：
- seqFISH+_NIH3T3_point_locations.zip：压缩文件，包含3个Matlab文件，其中1个为基因名称文件，另外2个分别是两次重复实验的mRNA点位置数据，字段含视野（FOV）、细胞编号、基因名称
- 辅助图像文件：
- DAPI_experiment1.zip：压缩文件，包含实验1的DAPI染色及其他珠子图像
- DAPI_experiment2.zip：压缩文件，包含实验2的DAPI染色及其他珠子图像
- 细胞分割文件：
- ROIs_Experiment1_NIH3T3.zip：压缩文件，包含实验1中通过ImageJ进行的全细胞手动分割数据
- ROIs_Experiment2_NIH3T3.zip：压缩文件，包含实验2中通过ImageJ进行的全细胞手动分割数据
适用场景
- 细胞生物学研究：分析NIH3T3细胞内mRNA的空间表达模式
- 基因表达分析：探究不同基因在细胞内的定位特征与表达关联
- 成像技术验证：支持seqFISH+成像实验的方法学验证与数据复现
- 生物信息学分析：结合细胞分割数据开展基因空间分布的定量分析
