数据集概述
本数据集包含拟南芥根际线虫、真菌、细菌的序列数据,根际微生物悬浮液的真菌、细菌序列及DNA浓度数据,南方根结线虫J2对番茄根的侵染数据,以及北方根结线虫对拟南芥根侵染压力的qPCR数据,共8个文件,均为xlsx格式。
文件详解
- qPCR_M_hapla_Roots.xlsx(XLSX格式):北方根结线虫(Meloidogyne hapla)对拟南芥根侵染压力的qPCR检测数据
- otu_Nematodes_Roots.xlsx(XLSX格式):拟南芥根际线虫的OTU(操作分类单元)序列数据
- otu_Fungi_Roots.xlsx(XLSX格式):拟南芥根际真菌的OTU序列数据
- otu_Fungi_Microbial suspension.xlsx(XLSX格式):拟南芥根际微生物悬浮液中真菌的OTU序列数据
- otu_Bacteria_Roots.xlsx(XLSX格式):拟南芥根际细菌的OTU序列数据
- otu_Bacteria_Microbial suspension.xlsx(XLSX格式):拟南芥根际微生物悬浮液中细菌的OTU序列数据
- J2 penetration.xlsx(XLSX格式):南方根结线虫(Meloidogyne incognita)J2对番茄根的侵染数据
- DNA concentration.xlsx(XLSX格式):拟南芥根际微生物悬浮液的DNA浓度数据
数据来源
标题为“Genetic disruption of synthesis pathways of Arabidopsis secondary metabolites dramatically affects root-associated nematode populations directly and via modulation of microbial communities”的研究
适用场景
- 植物次生代谢研究:分析拟南芥次生代谢合成通路对根际生物的影响机制
- 根际微生态研究:探究根际线虫与微生物群落的互作关系
- 植物病理研究:解析根结线虫对植物根的侵染规律及防控靶点
- 微生物组学研究:利用OTU数据开展根际真菌、细菌群落结构分析
- 分子生物学实验:基于qPCR和DNA浓度数据验证基因调控对根际生物的作用