数据集概述
本数据集基于27项已发表及未发表的拟南芥磷酸化蛋白质组学质谱数据进行元分析,涵盖多种组织类型、细胞培养及生物学过程,生成包含60,366个磷酸肽的数据集,经质量过滤得到中高置信度磷酸化蛋白及位点,分析其亚细胞定位、功能分布及磷酸化基序的区室化特征。
文件详解
- 补充图表文件:
- SupplementalFigure-2revised.pdf:PDF格式,修订后的补充图2
- SupplementalFigure_1A.jpeg、SupplementalFigure_1B.jpeg:JPEG格式,补充图1的A和B部分
- 补充数据集文件(共10个XLSX格式文件,示例如下):
- SupplementalDataset_1r.xlsx:补充数据集1r,包含磷酸化蛋白质组学相关数据
- SupplementalDataSet_3r.xlsx:补充数据集3r,涉及磷酸化位点或蛋白功能分析数据
- SupplementalDataSet_5r.xlsx:补充数据集5r,可能包含亚细胞定位或基序分析数据
- SupplementalDataSet_7r.xlsx:补充数据集7r,包含磷酸化基序或激酶关联分析数据
- SupplementalDataSet_10r.xlsx:补充数据集10r,涉及数据质量过滤或置信度分析数据
- SupplementalDataSet_4r.xlsx:补充数据集4r,可能包含多磷酸化肽或位点分布数据
- SupplementalDataSet_8r.xlsx:补充数据集8r,涉及磷酸化酪氨酸(pY)分布或比较分析数据
适用场景
- 植物分子生物学研究:分析拟南芥磷酸化信号网络及激酶-底物关系
- 亚细胞蛋白质组学研究:探究不同细胞器中磷酸化蛋白的分布特征
- 生物信息学分析:验证磷酸化基序识别算法及激酶基序关联方法的有效性
- 蛋白质组学方法学研究:评估大规模磷酸化蛋白质组数据的质量控制与整合策略
- 植物生理学研究:解析磷酸化修饰在拟南芥生长发育及环境响应中的作用机制