拟南芥sORF分析流程数据集

数据集概述

该数据集包含运行《分子生物学方法》中sORF分析流程所需的拟南芥相关数据,涵盖基因组序列、索引文件、RNA序列及注释文件等,为sORF分析提供基础数据支持。

文件详解

  • 文件名称: sORF_pipeline/TAIR10.fa.fai,文件格式: .fai,为TAIR10.fa的索引文件
  • 文件名称: sORF_pipeline/TAIR10.fa,文件格式: .fa,拟南芥基因组序列(FASTA格式)
  • 文件名称: sORF_pipeline/Araport11_201606_t_r_sn_snoRNA.fasta,文件格式: .fasta,用于去除tRNA、rRNA等污染序列的参考序列
  • 文件名称: sORF_pipeline/Araport11_20250128.gtf,文件格式: .gtf,拟南芥基因注释文件
  • 文件名称: sORF_pipeline/Note.txt,文件格式: .txt,包含各文件用途说明的文本文件

适用场景

  • 拟南芥sORF分析流程的复现研究
  • 植物基因组注释与小开放阅读框(sORF)识别研究
  • 分子生物学实验中拟南芥相关序列数据的预处理分析
  • 生物信息学工具在植物基因组数据处理中的应用研究
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 39.62 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月28日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。