数据集概述
本数据集是论文《A hotspot of groundwater amphipod diversity on a crossroad of evolutionary radiations》的补充数据，聚焦欧洲西巴尔干地区地下水端足类Niphargus属的生物多样性研究。包含物种丰富度、系统发育多样性等分析所需的原始数据、BEAST2分析文件及R脚本，支持重现研究中的多样性模式及演化过程分析，共涉及3类核心文件。
文件详解
- 分析脚本与配置文件
- 文件名称：20220124_niphargus_wbalkans.R
- 文件格式：R脚本
- 字段映射介绍：包含基于网格法的物种丰富度、系统发育多样性（Faith's PD）计算及标准化效应量分析代码，需配合解压后的data文件夹运行
- 文件名称：beast_analysis.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：记录512个Niphargus MOTUs（单基因界定分类单元）的多基因比对序列及BEAST2时间校准系统发育分析的参数设置
- 原始数据压缩包
- 文件名称：data.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含物种分布数据（species_occurence.csv）、地图shape文件、系统发育树文件（beast.tree）等分析依赖的原始数据
- 说明文档
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集内容说明，包括文件用途、访问方式及DOI链接信息
数据来源
Zenodo（DOI链接发布于Dryad平台Software板块：https://doi.org/10.528....）
适用场景
- 地下水生物多样性评估：分析西巴尔干地区Niphargus属端足类的物种丰富度及空间分布热点
- 系统发育多样性研究：基于时间校准的系统发育树，探究该属的演化辐射过程及生物多样性形成机制
- 保护生物学分析：通过物种丰富度与系统发育多样性的关联，优化地下水生态系统的保护优先级策略
- 生物信息学方法验证：复现基于MOTUs的隐存多样性分析及网格法生物多样性计量流程
- 演化生态学研究：解析不同区域（西北vs东南巴尔干）生物多样性模式的驱动因素（扩散vs本地辐射）
