牛背梁疫霉属新种系统发育分析数据集

数据集概述

本数据集为牛背梁疫霉属新种(Phytopythium niubeiliangense sp. nov.)的系统发育分析数据,包含贝叶斯树、最大似然树构建过程中的模型选择结果、输入文件、日志及摘要文件,支持该新种分类地位的分子生物学验证。

文件详解

该数据集包含多个目录及文件,具体说明如下: - 贝叶斯树分析文件(位于bayes_tree/目录): - input.nex:多基因联配序列数据文件(NEXUS格式) - PhyloSuite_MrBayes.log:MrBayes软件运行日志文件 - summary and citation.txt:贝叶斯树分析结果摘要与引用说明 - 贝叶斯树模型选择文件(位于bayes_tree_model selection/目录): - best_scheme_and_models.csv:最优分区方案与进化模型表(CSV格式) - log.txt:模型选择过程日志文件 - partition_finder.cfg:PartitionFinder软件配置文件 - 最大似然树分析文件(位于ML_tree/目录): - RCL_5genes_rename.fas:五基因联合序列文件(FASTA格式) - PhyloSuite_IQ-TREE.log:IQ-TREE软件运行日志文件 - summary and citation.txt:最大似然树分析结果摘要与引用说明 - 最大似然树模型选择文件(位于ML_tree_model selection/目录): - best_scheme_and_models.csv:最优分区方案与进化模型表(CSV格式) - RCL_5genes_rename.fas:五基因联合序列文件(FASTA格式)

适用场景

  • 真菌分类学研究:验证牛背梁疫霉属新种的分类地位
  • 系统发育分析:比较贝叶斯与最大似然法构建的系统发育树差异
  • 进化模型选择:分析多基因序列的最优分区策略与替代模型
  • 分子生物学教学:作为系统发育分析实验的案例数据
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 10.15 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。