数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)NL334品系gpa-2(pk16)V基因突变体的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含实验元数据、视频追踪数据及行为特征提取结果,共3个文件。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:
gpa-2 (pk16)V R_2009_07_14__11_08_13__3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始或基础追踪数据,包含视频帧对应的线虫形态、位置等原始记录
- 文件名称:
gpa-2 (pk16)V R_2009_07_14__11_08_13__3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征数据,包含6306个分割骨架对应的行为参数(基于tierpsy软件分析结果)
- 文件名称:
gpa-2 (pk16)V R_2009_07_14__11_08_13__3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据交换格式文件,用于不同平台间的行为数据共享
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-2基因对秀丽隐杆线虫行为特征的影响,探究基因表型关联
- 线虫行为学分析: 基于视频追踪数据和特征参数,研究线虫的运动模式、轨迹特征等行为规律
- 模式生物实验方法验证: 参考实验方案(如Yemini et al.方法),验证线虫行为实验的标准化流程
- 生物信息学工具应用: 测试和优化tierpsy等线虫行为分析软件的特征提取算法性能