数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)NL787品系(携带gpa-11(pk349)II基因突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成虫雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为特征,包含视频追踪数据及处理后的特征文件,可用于分析该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:gpa-11 (pk349)II on food L_2010_03_04__13_04_37__13.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始或标准化数据,具体内容需解压后查看
- 特征数据文件
- 文件名称:gpa-11 (pk349)II on food L_2010_03_04__13_04_37__13_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,可能包含运动轨迹、身体姿态等特征参数
- 核心数据文件
- 文件名称:gpa-11 (pk349)II on food L_2010_03_04__13_04_37__13.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的基础数据,如20408个分割骨架数据、帧率(25.974帧/秒)、视频像素对应微米数(4.3011微米/像素)等实验参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析gpa-11基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 神经行为学分析: 研究线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为等特征
- 生物信息学算法验证: 作为tierpsy等行为追踪软件的测试数据集,验证特征提取算法的准确性
- 模式生物实验复现: 为相关实验室复现该基因突变体的行为实验提供参考数据