数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫NL795品系(gpa-7(pk610)IV基因突变体)的行为实验数据,记录了成虫在含OP50食物的NGM培养基上的运动行为。实验由MRC分子生物学实验室完成,通过Tierpsy软件追踪分析,包含视频原始数据及处理后的行为特征数据,可用于研究gpa-7基因对秀丽隐杆线虫行为的调控作用。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:gpa-7 (pk610)IV on food L_2009_06_24__10_51_34__6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的WCON格式原始数据,记录线虫运动的时空坐标信息
- 核心行为数据文件
- 文件名称:gpa-7 (pk610)IV on food L_2009_06_24__10_51_34__6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫运动的原始追踪数据,包括6575个分段骨架的时空坐标、运动参数等基础行为数据
- 特征提取数据文件
- 文件名称:gpa-7 (pk610)IV on food L_2009_06_24__10_51_34__6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含经Tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,基于299.72秒、每秒26.18帧的视频分析结果,涵盖运动轨迹、身体姿态、速度等量化特征
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 模式生物行为遗传学研究: 分析gpa-7基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控机制
- 神经发育与行为表型关联分析: 探究基因突变体的行为表型差异及神经基础
- 行为分析算法验证: 用于测试或优化线虫行为追踪与特征提取算法的准确性
- 药物筛选与环境响应研究: 作为对照数据集,评估外界因素对秀丽隐杆线虫行为的影响