数据集概述
本数据集围绕遗传非侵入性采样在种群遗传监测中的有效性展开研究,以自由放养无尾熊种群(n=430)的高质量SNP数据为基础,分析了遗传非侵入性样本典型的SNP面板大小、检出率及采样强度对遗传多样性、近交系数、内部关联性等遗传指标准确性的影响,为保护决策提供数据支持。
文件详解
- README文档
- 文件名称:README_Dec2021.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含数据集的研究背景、实验设计、数据说明及使用建议等文档信息
- 基因型数据文件
- 文件名称:genotypes_file.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含样本编号、Diversity Arrays的样本和序号信息,可兼容dartR格式的数据重排
- 观测内部关联性数据文件
- 文件名称:observedIR.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含样本ID(sampleid)和内部关联性值(IR)两个字段
- 追踪数据文件
- 文件名称:Tracking_data.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含样本追踪相关的元数据或实验记录
- 样本元数据文件
- 文件名称:idmeta.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含样本身份、来源等元数据信息
数据来源
论文“Testing the effectiveness of genetic monitoring using genetic non-invasive sampling”
适用场景
- 种群遗传学研究: 分析无尾熊种群的遗传多样性、近交系数及遗传结构
- 保护生物学应用: 评估遗传非侵入性采样技术在实际保护决策中的有效性
- 采样方法优化: 研究不同采样强度对遗传监测结果准确性的影响
- 分子生态学分析: 应用SNP数据开展地理与遗传空间自相关分析
- 野生动物保护策略制定: 为自由放养物种的遗传监测方案提供科学依据