数据集概述
本数据集为挪威伦德猎犬遗传拯救研究的配套数据,包含该濒危犬种与挪威布哈德犬、冰岛牧羊犬、诺尔波顿斯皮茨犬三个北欧斯皮茨犬种的单核苷酸多态性(SNP)基因型数据,用于分析遗传多样性、遗传结构及选择信号,支撑通过杂交增加遗传多样性的策略研究。
文件详解
- README_for_NordicDogs_ID.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:PLOS ONE论文配套数据说明文档,包含数据来源、使用方法及文件清单等信息
- NordicDogs_4mars2014.map
- 文件格式:MAP
- 字段映射介绍:PLINK软件兼容的SNP位点定位文件,包含染色体、位点ID、遗传距离、物理位置等信息
- NordicDogs_4mars2014.ped
- 文件格式:PED
- 字段映射介绍:PLINK软件兼容的基因型数据文件,包含48只犬的家系信息、表型数据及165K SNP位点的基因型数据
- NordicDogs_ID.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:犬只身份信息表,包含样本编号、品种归属等基础信息
数据来源
PLOS ONE论文“Genetic rescue of an endangered domestic animal through outcrossing with closely related breeds: a case study of the Norwegian Lundehund”
适用场景
- 濒危动物遗传多样性评估:分析挪威伦德猎犬与候选杂交犬种的遗传多样性差异(如杂合度HE)
- 遗传结构分析:通过FST值和遗传聚类研究犬种间的遗传分化程度
- 选择信号检测:识别犬种间适应性差异相关的候选基因区域,探究免疫、代谢等功能相关基因
- 杂交育种策略优化:为濒危犬种通过跨品种杂交恢复遗传多样性提供数据支撑
- 动物保护政策制定:为濒危家养动物种群的遗传管理与拯救方案提供科学依据