数据集概述
本数据集源自“温度和降水通过调控生长季启动共同塑造植物微生物组”相关研究,包含17个文件,涵盖样本信息、微生物组测序数据、多样性分析结果、土壤化学数据及实验说明文档等。数据聚焦温度和降水对植物微生物组的影响,支持相关生态学机制研究,文件类型以R数据文件(.rda)为主,辅以文本、表格和文档格式。
文件详解
- R数据文件(.rda):共7个,包含微生物组多样性分析、ASV稀疏化数据、植被及株高数据等,如
adiv_ITS_both_ss1234.RDa(ITS区域多样性数据)、SI_rhizo_ITS_ASV_rare_noprune_ss1234.RDa(根际ITS ASV稀疏数据)、dataHeight_2019.RDa(2019年株高数据)、Mveg_2019.RDa(2019年植被数据)
- 文本文件(.txt):共5个,包含样本基础信息、结构方程模型结果等,如
sample_info_both.txt(含样本编号、位置、微生境、重复组、降水、温度等字段)、PC_SEM_5.0.txt(结构方程模型参数)、SEM_results_5.0.txt(模型结果)、Explained_variation_clusters_5.0.txt(聚类解释度数据)、soil_chemistry_both.txt(土壤化学数据)
- 表格文件(.tsv):共4个,包含微生物ASV分类和计数数据,如
ASVs_taxonomy_nohit_nocontam_ITS_blk1contam.tsv(ITS区域ASV分类信息)、ASVs_counts_nohit_nocontam_ITS_blk1contam.tsv(ITS区域ASV计数数据)、ASVs_taxonomy_nohit_nochloro_nomito_nocontam_16S_blk1contam.tsv(16S区域ASV分类信息)、ASVs_counts_nohit_nochloro_nomito_nocontam_16S_blk1contam.tsv(16S区域ASV计数数据)
- 文档文件(.docx):1个,即
README_Norway.docx,为实验说明文档
适用场景
- 植物微生物组环境调控机制研究:分析温度和降水对植物微生物组结构、多样性的影响及作用路径
- 生态因子交互效应分析:探究温度与降水联合作用对植物生长季启动及微生物组塑造的调控机制
- 微生物组多样性与环境因子关联分析:基于ASV数据和环境参数,解析微生物群落组成与温度、降水的相关性
- 结构方程模型验证:利用SEM结果文件,验证生态因子对植物微生物组影响的路径模型假设
- 土壤-植物-微生物互作研究:结合土壤化学数据、植被数据及微生物组数据,分析三者间的相互关系