Not_Scared_of_Chemistry_Based_多源整合化学知识图谱数据

数据集概述

本数据集是整合ExCAPE-DB、BioGRID、HomoloGene及化学相似性数据构建的知识图谱，包含元数据文件和三元组文件，原始数据采用CC-0 1.0协议，衍生数据遵循各源数据许可协议，由nsockg工具自动生成。

文件详解

• metadata.json
• 文件格式：JSON
• 字段映射介绍：包含date（日期）、exporter（导出工具）、versions（版本信息）、statistics（统计信息）四个键值对，记录知识图谱的元数据信息
• triples.tsv
• 文件格式：TSV
• 字段映射介绍：包含化学物质与基因的调控关系三元组，示例内容为inchikey（化学物质标识）、modulates（关系类型）、ncbigene（基因标识）的组合

数据来源

https://github.com/cthoyt/nsockg

适用场景

• 化学信息学研究: 用于分析化学物质与基因之间的调控关系
• 知识图谱构建参考: 为多源生物化学数据整合构建知识图谱提供示例
• 药物靶点预测: 基于化学物质-基因调控关系挖掘潜在药物靶点
• 生物数据跨库关联分析: 整合ExCAPE-DB、BioGRID、HomoloGene多源数据开展关联研究