数据集概述
本数据集包含南美洲假山毛榉属Lophozonia亚属3个物种(N. obliqua、N. alpina、N. glauca)的种群遗传研究数据,基于7个多态性微卫星位点对智利40个种群共640个个体的分析结果,用于探究末次冰期对其遗传结构和空间分布的影响,支持多避难所假说的验证。
文件详解
- 文件名称:README_for_Msat Data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含微卫星数据集的表头说明,涉及物种(Species)、种群(Population)、样本(Sample)及微卫星位点(如ncut06、ncut08、ncut12等)的定义,其中样本编码区分自然种群直接采样(1-30)与子代种源试验采样(如"323-1")。
- 文件名称:Msat Data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含种群遗传分析的核心数据,涵盖物种、种群、样本及7个微卫星位点的基因分型信息,用于计算遗传多样性(HE)、遗传结构(RST)等参数。
数据来源
论文“Population genetic structure, genetic diversity, and natural history of the South American species of Nothofagus Subgenus Lophozonia (Nothofagaceae) inferred from nuclear microsatellite data”
适用场景
- 种群遗传学研究:分析南美洲假山毛榉属物种的遗传多样性水平、种群遗传结构及基因流模式。
- 冰期避难所验证:通过遗传数据重建末次冰期对南美洲植物种群分布的影响,支持多避难所假说。
- 物种杂交与基因渐渗分析:探究N. alpina与N. obliqua之间的基因交流及渐渗现象。
- 植物保护策略制定:基于种群遗传结构信息,为南美洲假山毛榉属物种的保护和管理提供科学依据。
- 微卫星标记应用参考:为植物种群遗传研究中微卫星位点的选择和数据分析提供方法参考。