数据集概述
本数据集包含用于研究蝌蚪虾(Notostraca)系统发育与分化时间的多基因序列数据及分析文件。蝌蚪虾作为被认为是“活化石”的古老甲壳动物,本数据通过多基因联合分析揭示其存在多次全球辐射分化事件,挑战传统“活化石”概念。数据集含三个核心文件,支持节肢动物进化研究。
文件详解
- 多基因序列文件:
- 文件名称:Branchiopoda_Art_and_Strep_OG_Muscle_no_introns.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:包含12S、16S、28S、COI、EF1a、Gkycogen Synthase、RNA Polymerase II等多基因序列的超级矩阵比对数据,各基因区间明确划分。
- 说明文档:
- 文件名称:README_for_Branchiopoda_Art_and_Strep_OG_Muscle_no_introns.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明超级矩阵比对的基因分区方案,列出各基因对应的序列区间位置(如12S对应1-622位、16S对应623-1167位等)。
- 分析元数据文件:
- 文件名称:Run_with_data_1.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:包含系统发育分析相关的元数据信息,支持分化时间推断等进化分析。
数据来源
论文“Multiple global radiations in tadpole shrimps challenge the concept of 'living fossils'”
适用场景
- 节肢动物系统发育研究:利用多基因序列数据构建蝌蚪虾及相关甲壳动物的系统发育树,分析类群亲缘关系。
- 生物进化时间推断:结合化石校准点,通过多基因数据推断蝌蚪虾的分化时间,揭示其进化历史。
- “活化石”概念验证:通过分化事件分析,验证蝌蚪虾是否存在多次辐射分化,挑战传统“活化石”定义。
- 甲壳动物进化机制研究:分析蝌蚪虾全球辐射分化的驱动因素,探究古老生物类群的适应性进化机制。