数据集概述
本数据集围绕核受体NR2C1在人类进化中作为多能性调控因子的功能分化展开，包含48个核受体序列比对文件及相关分析文档。通过三阶段研究（分子进化分析、选择压力检测、功能实验验证），探究NR2C1对干细胞多能性关键基因（Oct4、Nanog）转录调控、分化标志物（Pepck）启动子活性及干细胞集落大小的影响，揭示基因调控适应性进化对灵长类多能性的作用。
文件详解
- 文档文件（Document files）
- 文件名称：README_for_paml_files_for_dryad.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明伴随论文的核受体序列比对文件相关信息，为PAML分析提供背景。
- 文件名称：README_for_4cat_structural_partitions.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：阐述4分类结构分区相关内容，辅助理解序列分区分析逻辑。
- 压缩文件（Archive files）
- 文件名称：4cat_structural_partitions.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含4分类结构分区的相关数据文件，用于序列结构分区分析。
- 文件名称：paml_files_for_dryad.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：存储用于PAML分析的核受体序列比对文件，支持分子进化与选择压力检测。
数据来源
论文“Functional divergence of the nuclear receptor NR2C1 as a modulator of pluripotentiality during hominid evolution”
适用场景
- 核受体分子进化研究：分析灵长类核受体NR2C1的结构域进化及选择压力变化。
- 基因调控适应性进化分析：探究NR2C1在人类进化中对干细胞多能性关键基因转录调控的适应性改变。
- 干细胞多能性机制研究：通过NR2C1对Oct4、Nanog及Pepck的调控作用，解析干细胞自我更新与分化的分子机制。
- 进化与功能实验整合策略验证：验证靶向进化分析与功能实验结合研究基因调控进化的有效性。
