数据集概述
本数据集围绕rpb2基因作为环境真菌群落分析替代分子标记展开，对比其与ITS标记在云杉林表层土壤真菌群落分析中的适用性。包含模拟群落数据、OTU表及系统发育树数据，支持评估rpb2基因在分类覆盖、定量准确性和系统发育分析中的优势，共6个文件。
文件详解
- 模拟群落序列文件
- 文件名称：MOCK_ITS.fas、MOCK_rpb2.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：包含模拟群落中真菌的ITS和rpb2基因序列数据，用于验证两种标记的群落分析效果
- OTU表文件
- 文件名称：OTU_tables.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基于rpb2和ITS标记得到的真菌操作分类单元（OTU）丰度表，用于对比群落组成的定量差异
- 系统发育树数据文件
- 文件名称：tree_data_Figure2.nex、tree_data_Figure2.fas、tree_data_Figure2.tre
- 文件格式：NEX、FAS、TRE
- 字段映射介绍：包含用于构建系统发育树的序列数据（FAS）、树结构数据（TRE）及相关分析文件（NEX），支持rpb2基因的系统发育分析
数据来源
论文“The rpb2 gene represents a viable alternative molecular marker for the analysis of environmental fungal communities”
适用场景
- 真菌分子标记比较研究: 对比rpb2基因与ITS标记在环境真菌群落分析中的分类覆盖、定量准确性及系统发育适用性
- 土壤真菌群落结构分析: 利用OTU表数据研究云杉林表层土壤中真菌群落的组成与多样性
- 微生物系统发育研究: 通过系统发育树数据开展真菌类群的亲缘关系与进化分析
- 环境微生物监测技术优化: 评估rpb2基因作为替代标记在环境真菌群落监测中的应用潜力
