数据集概述
本数据集围绕气候变化敏感哺乳动物美洲鼠兔(Ochotona princeps)展开,聚焦其在加拿大不列颠哥伦比亚省海岸山脉北部分布区沿海拔梯度的适应性分化。通过扩增片段长度多态性(AFLP)基因组扫描,筛选出68个受选择候选基因座,其中15个与年降水量、夏季最高温等环境变量显著关联,为预测鼠兔对气候变化的响应及野生动物保护提供依据。
文件详解
- 文件名称:AFLPsurv_allsites.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含美洲鼠兔不同海拔梯度种群的基因组位点数据,记录样本编号(如PIKA_E31T37_50.6)及对应基因组位点信息,共涉及1509个位点数据。
- 文件名称:AFLPfreq&Envdata.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含美洲鼠兔种群的等位基因频率数据及对应的环境变量数据,环境变量涵盖年降水量、夏季最高温等关键气候因子。
数据来源
论文“Adaptive divergence along environmental gradients in a climate-change-sensitive mammal”
适用场景
- 气候变化适应性研究:分析美洲鼠兔沿海拔梯度的基因组分化与气候因子的关联,预测物种对气候变化的响应。
- 生物多样性保护策略制定:基于受选择候选基因座信息,为气候变化敏感物种的保护提供靶向依据。
- 基因组适应性机制研究:探究环境梯度驱动下哺乳动物种群的局部适应遗传机制。
- 生态因子关联分析:通过等位基因频率与环境变量的关联,揭示气候因子对物种遗传结构的影响。